Bioinformatics for DNA chip Probe Design

Kyusang Lee

삼성종합기술원, CSE Center, Bioinformatics technology group

2001. 8. 14

삼성종합기술원의 Bioinformatics team 에서는 Biochip의 성공적인 개발과 이용을 위한 연구와 더불어 Bioinformatics 연구에 필수 적인 연구 기반도 아울러 확충하여 bio 사업 기반을 조기에 구축하고 있다. 우선적으로 가장 먼저 구축하는 것이 Cyber-organism을 닮은 Database system으로서 세계적으로 정부와 국공립 연구소에서 구축된 생물학 database를 매일 점검하여 기술원 내에 구축하는 살아 있는 database system이다. 이 database는 외부에 있는 약간은 오염된 유전 정보 database의 정보를 매일 자동적으로 최신 정보로 받아서 오류를 자동 check하고 연구에 직접 활용할 수 있는 상태까지 가공하여 user에게 service 할 수 있는 system 이다. 이 system을 활용하면, 매일 매일 어떤 유전 정보의 상호 연관관계를 자동으로 분석하여 연구자에게 알려 줌으로써 연구 효율을 대폭 향상할 수 있다. 두번째로 역점을 두어 구축하는 부분은 database와 연동되는 DNA chip의 자동 design system이다. 기술원에서 개발하는 DNA chip의 design과 이후 검증에 필요한 모든 정보를 일목 요연하게 가공 관리할 수 있는 system으로서 DNA chip 개발과 사업화에 핵심적인 system이다. 세번째 역점 과제는 개인간의 유전차이를 분석하여 질병과의 연관성을 연구하여 진단과 치료에 응용할 수 있는 SNP 분석 system이다. 이를 위해서는 환자와 정 상인으로부터 얻은 sample을 실험 장비에서 생산되는 수많은 데이터와 외부에서 들여온 가공된 data를 종합하여 정보를 생산해야하므로 앞에서 말한 infrastructure 위에 훨씬 종합적인 system을 구축해야하며, 이를 위해서는 database와 software integration technology, web interface등 다양한 기술이 필요하다.


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Last update: Aug 13, 2001