AptaCDSS:

Aptamer chip-based Clinical Decision Support System


개 요

기계학습 기법을 이용하여 심혈관 질환을 진단하는 진단 모델 및 시스템의 구현

  • 심혈관 질환의 특징 이해
  • 기계학습을 이용한 질환 진단 개념의 정립
  • 새로운 진단압타머 기반 바이오칩 관련기술의 이해
  • 압타머 칩 기반 심혈관 질환 데이터 처리를 위한 Microarray data 처리 기술 개발
  • 진단 성능 및 모델 예측 결과의 가독성을 함께 제공하는 진단모델 개발


바이오칩 및 인공지능/기계학습 기반 질병 진단의 개념

 

AptaCDSS 시스템 개요

 

  본 과제는 서울대학교 컴퓨터공학부 바이오지능연구실(장병탁 교수)과 제노프라(주), 그리고 (주)씨오텍의 공동연구로 이루어졌다.  실험을 위한 심혈관 질환 데이터는 서울 삼성병원에서 제공되었다.

 ▒  AptaCDSS  

  • SVM, NN, DT, BN의 4가지 알고리즘을 복합적으로 사용하는 CDSS 구현
  • 데이터 전처리 및 환자/데이터별 진단모델 Profiling이 가능한 엔진 개발
  • 질환의 효율적 진단을 위한 후보 진단마커 추천기능 개발
  • 병원에서 지속적으로 제공되는 환자 데이터를 활용한 모델 갱신 및 데이터마이닝 기반 플랫폼 구현
  • 칩데이터의 구성 및 획득, 데이터 분석 및 진단결과를 이용한 임상의/진단의 지원 통합 플로우를 제공하는 진단지원 모델 구현
  • PACS 및 HL7 고려를 통한 HIS(Hospital Infoamtion System)로의 확장이 가능한 질환 데이터 분석 및 진단 지원을 위한 통합 플랫폼 구현

     


AptaCDSS 시스템 구조

 


AptaCDSS 결과 프로그램 화면

Publications

  • Potential SVM을 이용한 압타머칩에서의 바이오마커 탐색, 김병희, 김성천, 장병탁, 한국정보과학회 가을학술발표 논문집, 제33권 2(A), pp. 22-27, 2006.
  • AptaCDSS - 압타머칩을 이용한 심혈관질환 질환단계 예측 및 진단의사결정지원시스템, 엄재홍,김병희,이제근,허민오,박영진,김민혁,김성천,장병탁, 한국정보과학회 가을학술발표 논문집, 제33권 2(A), pp. 28-32, 2006.
  • SVM 앙상블을 이용한 심혈관질환 질환단계 예측, 엄재홍, 장병탁, 한국컴퓨터종합학술대회 2006 논문집, 제33권 1(A), pp. 76-78, 2006.
  • 기계학습에 의한 압타머칩 데이터 기반 심혈관 질환 단계의 예측, 김병희, 김성천, 장병탁, 한국컴퓨터종합학술대회 2006 논문집, 제33권 1(A), pp. 85-87, 2006.


Project Title

Developing a diagnosis support system for cardiovascular disease using aptamer chip

Sponsor

CoTech Inc. & GenoProt Inc.

Principal Investigator

Prof.Byoung-Tak Zhang

Researchers

Jae-Hong Eom

Byoung-Hee Kim

Je-Keun Rhee

Min-Oh Heo

Min-Hyuk Kim

Young-Jin Park

Duration

2005.9 - 2006.8

Cooperative Research Institutes

CoTech Inc., GenoProt Inc.


Contact  Jae-Hong Eom
E-Mail
Phone  +82-2-880-1847
Fax  +82-2-875-2240