MicroGene

Microbial Gene Identification Using Probabilistic Graphical Models


1. Project Overview

  생물의 전체 게놈의 염기서열을 얻게 되면, 얻어진 많은 양의 염기서열 데이터로부터 생명현상의 이해와 관련된 여러 정보를 얻어내기 위한 전산학적인 분석기법의 존재가 필수적이다. 게놈의 염기서열 자체는 A,C,G,T의 네 염기가 길게 이어진 문장일 뿐 이 서열 자체로는 큰 의미를 부여하기 힘들며 이러한 염기서열에서 필요한 정보를 얻고 가공하여야만 인간에게 이익을 가져오는 결과를 얻을 수가 있다. 게놈의 완전한 해독은 장차 부가적인 연구에 의해 창출되는 다양한 성과의 기초이며 따라서 게놈의 서열로부터 다양한 정보를 얻고 가공하는 생물정보학적 분석 기법 (Bioinformatics tool)이 절실히 요구된다. 이러한 분석기법은 다방면에 걸쳐 다양하게 존재하나 기초적인 단계로서 기본적으로 유전자의 위치를 게놈 염기서열에서 예측하는 기법이 있다. 유전자는 생명현상의 기본적인 단계로서 전체 게놈의 염기서열을 본다는 것은 결국 게놈 내에 존재하는 모든 유전자를 발굴하는데 주요한 목적이 있으며 이를 수행하는 분석기법이 필수적이다. 사람의 염기서열을 비롯하여 많은 생물들의 염기서열이 공개된 것은 우리에게 행운이며 이를 이용할 수 있는 기법을 개발하여 염기서열에서 유용한 유전자를 찾아내어 이를 빠르게 생물산업에 응용하는 것이 중요하다.

  본 연구는 게놈 서열이 밝혀진 미생물들의 데이터를 기초로 하여 미생물의 게놈에서 유전자를 밝혀내는 분석 도구를 만들고 이를 기존의 연구를 통해 유전자의 위치가 많이 밝혀진 E.coli의 게놈 염기서열에 적용하여 작성된 분석기법의 성능을 측정하고 검증을 한다.

 

2. Gene Identification and Prediction Concept

 

3. Project Objective

  미생물의 게놈 염기서열에서 유전자의 위치를 밝혀내는 새로운 분석 기법을 개발하고 이를 E.coli와 새로운 미생물의 염기서열에 적용하여 성능을 평가한다.


4. Publications
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Project Title

미생물 유전자 예측기법의 개발

Sponsor

㈜바이오인포메틱스

Duration

2001. 5. - 2002. 4.

Principal Investigator

Prof. Byoung-Tak Zhang

Researchers

Chul-Ju Kang
Je-Gun Joung
Jae-Hong Eom
Ho-Jin Chung


Contact

 Jae-Hong Eom

E-Mail

Phone

 +82-2-880-1835

Fax

 +82-2-875-2240


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Last update: May 9, 2001.