AngioProt:

Development of an angiogenesis analysis algorithm and its application to find a novel molecule


개 요

본 연구는 서울대학교 간접연구경비 학제적 협력연구 학술연구비 지원으로 수행되고 있으며 목표는 다음과 같다.

  • Angiogenesis 관련물질(protein 등) 정보의 데이터베이스화
  • Unsupervised machine learning 기법에 기반한 angiogenesis 관련물질 예측 알고리즘 개발
  • 개발된 알고리즘을 통한 새로운 angiogenesis 관련물질의 발굴
  • 발굴된 angiogenesis 관련물질의 생화학적 검증

본 과제는 서울대학교 약학대학 및 의과대학과의 공동연구로 이루어지고 있으며 본 팀은 제 2세부과제인 angiogenesis 관련물질 예측 알고리즘 개발을 담당하고 있다.

 

연구 추진 계획 및 방법

 

연구개발목표

연구개발 내용 및 범위

제 1세부과제

Angiogenesis 관련물질 정보 데이터베이스 구축

* 혈관신생관련 생리활성물질 정보의 집약

* 관련물질 예측 알고리즘 학습을 위한 학습데이터(training data) 제공

제 2세부과제

Angiogenesis 관련물질 예측 알고리즘 개발

* Hidden Markov model에 기반한 혈관신생관련물질 예측 알고리즘의 개발

* 개발된 알고리즘을 통한 혈관신생관련물질의 발굴

제 3세부과제

발굴된 angiogenesis 관련물질의 검증

* Chorioallantoic membrane에 의한 혈관신생 활성 조사

* 3H-thymidine incorporation assay 등에 의한 검증

 


Project Title

Development of an angiogenesis analysis algorithm and its application to find a novel molecule

Sponsor

Seoul National University

Principal Investigator

Prof.Byoung-Tak Zhang

Researchers

Sirk June Augh

Kyu-Baek Hwang

Dong-Yeon Cho

Jae-Hong Eom

Duration

Jul. 2001 - Jun. 2002

Cooperative Research Institutes

College of Pharmacy and School of Medicine, Seoul National University


Contact Kyu-Baek Hwang
E-Mail kbhwang@bi.snu.ac.kr
Phone +82-2-880-1847
Fax +82-2-875-2240