HyperSNP:

Hypergraph Modeling for Large-Scaling Data Analysis
 


개 요

당뇨 관련 risk factor를 예측하기 위한 하이퍼망 기반 분석 시스템 개발

  • 하이퍼망을 이용하여 중요 인자 선정을 위한 특성 선정 (feature selection) 모듈 및 질병 분류 (classification) 통합 모듈 개발
  • 하이퍼망을 통한 분석 결과로 도출된 중요 인자들 시각화 모듈 개발
  • 하이퍼망 기반 분석시스템을 국립보건연구원 유전체센터에 구축

본 과제는 질병관리본부 유전체센터의 당뇨 관련 SNP 정보 및 Cohort 데이터를 이용하여 연구를 수행한다.

 

 

 ▒ 주요 연구 내용 및 연구 성과

  • 유전체 데이터 분석을 위한 하이퍼망 모델링 기술 개발
  • 하이퍼망 기반 Explorative Analysis 및 Visualization 도구 개발
  • 코호트 데이터를 이용한 실제 SNP 데이터 분석에 적용
  • 다른 유전체 데이터 분석 알고리즘에 비해 우수한 성능
  • 하이퍼그래프 모델링 방식은 특히 Compound Marker의 발견에 유용

 

   - 연구 추진 체계 -

 

   - 시각화 화면 예 -

 

 

 

 ▒ 대 효과  

  • 질환 지표 발굴 생산성 향상
  • 분석 결과의 시각화를 통한 시스템의 활용성 극대화
  • 신규 데이터들에 대한 분석을 통한 선도적인 연구 결과 도출
  • 분석 알고리즘에 대한 유전체센터 자체 개발 역량 축적
  • 외부 대학, 연구소 등과의 공동 연구에 활용 가능
  • 대용량 바이오 데이터 분석에 대한 기술력 제고
 


Project Title

Hypergraph Modeling for Large-Scaling Data Analysis

Sponsor

Korea Centers for Disease Control and Prevention

Principal Investigator

Prof.Byoung-Tak Zhang

Researchers

Je-Keun Rhee

Jung-Woo Ha

Soo-Jin Kim

Min-Su Lee

Duration

2007. 11 - 2008. 1.


Contact Je-Keun Rhee
Phone +82-2-880-5890
Fax +82-2-883-9120